鉴于市区河道基本是无源之水，为增强河道生态基流，提高南淝河水体自净能力，合肥市建立了南淝河生态补水机制，市财政每年安排南淝河生态补水专项经费，根据南淝河水质情况，定期实施河道补水。
“十二五”以来，南淝河生态补水约6000万立方米，有效改善了河道水质。此外，结合污水处理厂提标改造(王小郢等市区污水处理厂提标改造后，主要出水指标达到地表水IV类)，扩大再生水河道补水。目前，许小河、关镇河、十五里河等再生水补水管网及泵站工程正在建设，预计明年底可投入使用。
【水污染治理】明年全市建成区基本告别黑臭水体
城市黑臭水体整治是国家水污染防治行动计划的一项重要内容。按照统一部署，合肥已经完成了市区水体的普查工作，排查上报黑臭水体23处，根据要求，2017年底前城市建成区将基本消除黑臭水体。
截至2016年7月底，蜀峰湾公园南湖生态治理工程已开工建设，完成工程量40%；河东水库生态修复工程施工单位已进场；许小河生态补水和王建沟河底清淤两项工程正在进行施工招标。市级考核的19个项目全部列入2016年大建设计划，已完工3处，开工建设2处， 其余14处正在加紧施工招标和前期工作。
目前，全市已建成污水处理厂26座，总处理规模达到173万吨/日。其中城区12座，总规模135万吨/日；四县一市14座，总规模38万吨/日。“十二五”以来，市区新建污水管道864.6公里，新建污水泵站5座，扩建污水泵站1座，新增污水输送能力10万吨/日。
新闻延伸
全市今年水环境重大工程一览
1.污水处理厂建设
今年，合肥在建污水处理厂5座，拟开工2座，新增污水处理规模62万吨/日。分别是：
①小仓房污水处理厂二期，规模10万吨/日，即将通水调试。
②十五里河污水处理厂三期，规模10万吨/日，计划2017年8月通水调试。
③清溪净水厂PPP项目，规模20万吨/日(全地埋式)，采用PPP模式建设，计划今年12月完成箱体结构施工，2017年5月通水调试。
④肥东污水处理厂三期，规模5万吨/日，已建成试运行。
⑤巢湖经开区花山污水处理厂，规模2万吨/日，已开始联动调试。
⑥胡大郢污水处理厂，规模10万吨/日(全地埋式)，采用PPP模式建设，下半年开工建设。
⑦于湾污水处理厂一期，规模5万吨/日，已完成立项、可研，正在编制PPP项目实施方案，计划年底完成招标，2017年底建成。
2.污泥资源化利用PPP项目。
规模600吨/日，2015年9月开工建设，计划2016年底一期(规模200吨/日)建成投产。
3.再生水利用工程。
开工建设许小河、关镇河生态补水工程，规模为10万吨/日；完成高新区热电联产再生水利用工程(规模为5万吨/日)前期工作。
